More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1611 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  72.86 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  66.67 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  63.85 
 
 		 219 aa  271  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  64.04 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  61.11 
 
 		 223 aa  257  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  58.45 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.88 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.21 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.79 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.65 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.31 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.67 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.95 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 901 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  39.27 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.16 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.67 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  43.23 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.76 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.04 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.1 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  42.65 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.59 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  39.44 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.56 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.36 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  40.76 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.15 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.99 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.31 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.34 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  36.74 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  43.32 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.1 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  46.56 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.2 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  41.23 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  39.22 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  37.86 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.75 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  38.1 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  40.67 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  37.61 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  45.14 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  42.78 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.02 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  41.26 
 
 		 207 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  37.02 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  44.07 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.69 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  45.56 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 686 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  36.98 
 
 		 209 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.78 
 
 		 705 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  37.96 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  38.79 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  37.98 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 686 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  39.09 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  41.04 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>