More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1165 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  55.66 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  56.84 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  54.73 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  53.37 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  53.17 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  53.16 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  55.26 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  51.24 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  52.38 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  56.08 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  50.5 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  46.12 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.32 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  45.21 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 901 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  54.4 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.91 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  51.05 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  51.94 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48.96 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  47.74 
 
 		 703 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.51 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 705 aa  174  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  49.47 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.44 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  44.75 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 707 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50.25 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 688 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 671 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 686 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  50 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  47.06 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  47.59 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.78 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.32 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  42.51 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  48.15 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.23 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.21 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 686 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.07 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  47 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.74 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.21 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.21 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.31 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.26 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  48.26 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  44.08 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  47.21 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.39 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  45.18 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.81 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  45.08 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.67 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  46.03 
 
 		 688 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.63 
 
 		 209 aa  158  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>