More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1581 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  62.39 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  63.76 
 
 		 226 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  62.1 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  62.2 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  60.85 
 
 		 214 aa  267  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  61.14 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  60.78 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  56.78 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  58.54 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  56.13 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  60.61 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  59.68 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  54.95 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  48.82 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  55.77 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  58.42 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  61.54 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  60.41 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  61.08 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  58.13 
 
 		 217 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  56.22 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  53.69 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  51.85 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  54.77 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  48.76 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  51.81 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  46.82 
 
 		 705 aa  181  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 686 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  48.04 
 
 		 703 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  55.24 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  44.28 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.83 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 901 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.93 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.88 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.17 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.55 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 686 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 207 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  44.1 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.16 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.4 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 671 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.67 
 
 		 688 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.98 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.41 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  49.77 
 
 		 210 aa  161  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.27 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  49.2 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 688 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.69 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  45.92 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  45.54 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 707 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  46.57 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.54 
 
 		 662 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.13 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.27 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>