More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1575 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  69.76 
 
 
209 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  58.74 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  57.97 
 
 
210 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  55.07 
 
 
214 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  51.71 
 
 
213 aa  226  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  51.69 
 
 
208 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  50.72 
 
 
208 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  50.72 
 
 
208 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  52.74 
 
 
213 aa  216  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  50.25 
 
 
208 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  50 
 
 
213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  48.77 
 
 
203 aa  197  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  48.77 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  47.76 
 
 
205 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  47.76 
 
 
205 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.75 
 
 
213 aa  187  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.39 
 
 
219 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.98 
 
 
212 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.33 
 
 
213 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  45.41 
 
 
213 aa  176  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.89 
 
 
207 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.29 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.83 
 
 
216 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.16 
 
 
206 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.63 
 
 
225 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.15 
 
 
205 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  46.15 
 
 
203 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  42.08 
 
 
209 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.92 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  44.88 
 
 
210 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.23 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.62 
 
 
218 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.75 
 
 
686 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.77 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.98 
 
 
221 aa  161  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40 
 
 
686 aa  161  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.85 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.94 
 
 
229 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40 
 
 
671 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.08 
 
 
210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.08 
 
 
210 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.2 
 
 
226 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.84 
 
 
207 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.07 
 
 
210 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.88 
 
 
210 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.59 
 
 
204 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.14 
 
 
203 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.75 
 
 
215 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.94 
 
 
202 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.59 
 
 
219 aa  157  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.62 
 
 
213 aa  157  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.88 
 
 
210 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  42.93 
 
 
211 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.62 
 
 
205 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40 
 
 
210 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.83 
 
 
224 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.42 
 
 
217 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  40 
 
 
222 aa  154  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  43.63 
 
 
204 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  38.89 
 
 
217 aa  154  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  47.18 
 
 
225 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  46.67 
 
 
225 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  41.63 
 
 
206 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44 
 
 
223 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44 
 
 
223 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  38.89 
 
 
217 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.91 
 
 
217 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.04 
 
 
233 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  41.35 
 
 
232 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.72 
 
 
214 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.72 
 
 
234 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42 
 
 
206 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  39.81 
 
 
226 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  37.8 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.05 
 
 
215 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  42.13 
 
 
211 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  37.93 
 
 
236 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  41.84 
 
 
210 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  39.52 
 
 
215 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  39.81 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  38.42 
 
 
226 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.54 
 
 
200 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.89 
 
 
703 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.8 
 
 
901 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.83 
 
 
212 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  41.26 
 
 
206 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  40.48 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  37.93 
 
 
203 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  37.98 
 
 
204 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  40.4 
 
 
218 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>