More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4023 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  91.49 
 
 		 703 aa  1194    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  57.86 
 
 		 707 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  100 
 
 		 705 aa  1365    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  45.85 
 
 		 688 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.48 
 
 		 686 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 901 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.7 
 
 		 686 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 730 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  40.86 
 
 		 709 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.85 
 
 		 662 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.96 
 
 		 707 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  39.94 
 
 		 671 aa  340  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 710 aa  336  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  37.59 
 
 		 642 aa  327  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 727 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 725 aa  261  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  65.7 
 
 		 213 aa  238  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  58.85 
 
 		 224 aa  214  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  57.89 
 
 		 225 aa  208  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  56.67 
 
 		 210 aa  202  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  55.02 
 
 		 222 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  52.4 
 
 		 232 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  56.8 
 
 		 210 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  53.59 
 
 		 243 aa  196  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 226 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  54.29 
 
 		 215 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 206 aa  188  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.29 
 
 		 207 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  51.9 
 
 		 202 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  51.04 
 
 		 234 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.82 
 
 		 225 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.05 
 
 		 217 aa  180  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.52 
 
 		 207 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.89 
 
 		 207 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 210 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 281 aa  177  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 205 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 217 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  48 
 
 		 214 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.32 
 
 		 210 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.65 
 
 		 216 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.74 
 
 		 214 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 211 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.06 
 
 		 211 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 210 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  47.44 
 
 		 221 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.2 
 
 		 219 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.95 
 
 		 213 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.76 
 
 		 221 aa  170  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 218 aa  170  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 210 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 219 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.3 
 
 		 224 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  45.24 
 
 		 212 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 214 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.16 
 
 		 213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.33 
 
 		 215 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 236 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44 
 
 		 226 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 210 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 206 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  43 
 
 		 209 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.67 
 
 		 222 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  48.5 
 
 		 215 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 208 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 207 aa  164  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 206 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 206 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 206 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.85 
 
 		 211 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.46 
 
 		 225 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  47.78 
 
 		 240 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40 
 
 		 206 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 210 aa  161  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 205 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 206 aa  161  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 206 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 206 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 216 aa  160  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  47.31 
 
 		 225 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 208 aa  160  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 213 aa  160  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  47.69 
 
 		 226 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 207 aa  158  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 208 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 207 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 219 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 217 aa  158  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 230 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 206 aa  157  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 234 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.08 
 
 		 218 aa  157  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 212 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.81 
 
 		 234 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  46.11 
 
 		 208 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>