More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1634 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  56.65 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  57.65 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  56.63 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  56.37 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  54 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  56.37 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  56.48 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  55.02 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  54.9 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 211 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  50 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  48.02 
 
 		 212 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  52.58 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  47.69 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  50 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  51.23 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  48.5 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.67 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  50 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  51.2 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  48.47 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  47.2 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  47.2 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  47.2 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.39 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.15 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  47.45 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 209 aa  175  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  47.87 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  46.73 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.47 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.93 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  45.85 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  47.64 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.98 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  45.28 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  47.76 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 688 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 901 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>