More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1543 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  56.28 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  58.13 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  57.64 
 
 		 206 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  56.65 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  57.71 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  57.79 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  55.24 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  55 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 206 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  55.05 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  57.29 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  52.2 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  58.21 
 
 		 210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  60.41 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  57.71 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  56.86 
 
 		 218 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  57.71 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  55.22 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 210 aa  200  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  54.41 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  52.04 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  53.5 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  51.79 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  56.25 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  56 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  55.78 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  54.04 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  49.01 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.32 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 221 aa  174  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  49.73 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  48.51 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.43 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44 
 
 		 901 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  47.42 
 
 		 662 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  46.45 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.31 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  48.33 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.81 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.07 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  48.29 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 686 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 686 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.24 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 688 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>