More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1939 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  96.6 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  84.95 
 
 		 206 aa  357  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  78.64 
 
 		 206 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  78.64 
 
 		 206 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  78.64 
 
 		 206 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  78.64 
 
 		 206 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  78.16 
 
 		 206 aa  333  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  78.16 
 
 		 206 aa  333  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  78.16 
 
 		 206 aa  333  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  77.67 
 
 		 206 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  77.67 
 
 		 206 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  77.18 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  77.18 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  77.18 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  77.18 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  77.18 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  76.21 
 
 		 206 aa  324  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  67.49 
 
 		 205 aa  285  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  68.63 
 
 		 200 aa  284  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  66.01 
 
 		 205 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  68.14 
 
 		 203 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  56.72 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  57.77 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 204 aa  230  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  57.35 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  57.51 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  54.72 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  54.25 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  56.1 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  61.46 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.72 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 210 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  51.23 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  55.61 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  49.27 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  53.37 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  50.95 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.28 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  49.76 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.89 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.96 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.13 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  45.69 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.88 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.39 
 
 		 219 aa  160  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  47.37 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.48 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.08 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.99 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.84 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.94 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 688 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  48.4 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.06 
 
 		 703 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 705 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>