More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2281 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  99.51 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  99.51 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  96.12 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  90.29 
 
 
206 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  90.29 
 
 
206 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  90.29 
 
 
206 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  89.32 
 
 
206 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  89.32 
 
 
206 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  88.35 
 
 
206 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  88.35 
 
 
206 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  81.07 
 
 
206 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  78.16 
 
 
206 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  77.18 
 
 
206 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  68.47 
 
 
205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  67.49 
 
 
205 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  67.65 
 
 
200 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  66.5 
 
 
205 aa  276  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  67.16 
 
 
203 aa  268  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  61.27 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  58.25 
 
 
205 aa  236  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  57.71 
 
 
203 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  58.33 
 
 
214 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  59.59 
 
 
211 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.67 
 
 
204 aa  223  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  53.99 
 
 
217 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  53.52 
 
 
217 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  57.92 
 
 
233 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  54.15 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.76 
 
 
211 aa  193  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  55.5 
 
 
226 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.67 
 
 
221 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.26 
 
 
210 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.54 
 
 
210 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.77 
 
 
210 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.54 
 
 
210 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  50.94 
 
 
220 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  50.97 
 
 
212 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.09 
 
 
210 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.09 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.56 
 
 
218 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  45.45 
 
 
223 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.02 
 
 
219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.6 
 
 
210 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.98 
 
 
223 aa  180  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  48.1 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.6 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  52.04 
 
 
215 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.76 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  48.79 
 
 
225 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.89 
 
 
214 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  50 
 
 
228 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.41 
 
 
208 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.05 
 
 
208 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  45.54 
 
 
206 aa  168  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  46.45 
 
 
226 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  44.06 
 
 
215 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  49.52 
 
 
215 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  46.39 
 
 
234 aa  158  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45.5 
 
 
224 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  44.33 
 
 
281 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.54 
 
 
662 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.35 
 
 
705 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.93 
 
 
703 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  47.52 
 
 
688 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.58 
 
 
212 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45.41 
 
 
214 aa  151  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  41.58 
 
 
210 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.06 
 
 
213 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  42.79 
 
 
208 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.61 
 
 
224 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.99 
 
 
232 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.65 
 
 
213 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.51 
 
 
901 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  47.18 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.87 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.55 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  41.46 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.44 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.62 
 
 
222 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.08 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.32 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.13 
 
 
686 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  38.61 
 
 
216 aa  143  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.44 
 
 
205 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.42 
 
 
203 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  39.15 
 
 
209 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  38.68 
 
 
209 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  38.57 
 
 
208 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.9 
 
 
224 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.25 
 
 
217 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  38.1 
 
 
208 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40 
 
 
209 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  38.68 
 
 
209 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>