More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2519 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  453  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  85.2 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  68.61 
 
 		 215 aa  292  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  63.84 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  63.84 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  62.16 
 
 		 221 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  66.82 
 
 		 228 aa  274  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  62.5 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  62.28 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  59.73 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  52.94 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  52.29 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  48.84 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  48.87 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  45.87 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  50.94 
 
 		 203 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  46.85 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 206 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  46.85 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  46.79 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  48.2 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  48.2 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  48.2 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.54 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.54 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.62 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.36 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  40.99 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.47 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  42.4 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.01 
 
 		 901 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  39.82 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  37.16 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  38.36 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.98 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40.71 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  38.22 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  44.24 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.4 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  39.25 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  39.44 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  39.13 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  41.82 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  41.9 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.81 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1918  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  43.26 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  42.13 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  36.11 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  37.17 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  32.74 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.84 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.85 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  36.53 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  36.87 
 
 		 686 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.99 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>