More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1802 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  97.09 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  97.57 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  97.57 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  97.57 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  97.09 
 
 		 206 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  89.32 
 
 		 206 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  86.89 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  80.1 
 
 		 206 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  79.61 
 
 		 206 aa  337  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  78.64 
 
 		 206 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  69.95 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  67.16 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  67.16 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 205 aa  278  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  68.47 
 
 		 203 aa  274  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  61.76 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  58.16 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  59.9 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  60.2 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  53.05 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  55.34 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  60.22 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  58.71 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  52.83 
 
 		 220 aa  195  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 211 aa  194  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.79 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  54.08 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  47.75 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  51.66 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 223 aa  177  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.98 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  51.2 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.58 
 
 		 688 aa  161  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 705 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.96 
 
 		 703 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  46.04 
 
 		 662 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  46.63 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.75 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 243 aa  154  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.38 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.21 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.44 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 901 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.03 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.02 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.81 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  45.08 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.16 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  39.09 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.5 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>