More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0966 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  81.64 
 
 		 211 aa  360  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  63.59 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  61.88 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  60.2 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  60.2 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  60.3 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  59.31 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  60.3 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  60.3 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 206 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 206 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  57.84 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 205 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  59.9 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  57.89 
 
 		 203 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  55.33 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  53.17 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  53 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  52.04 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  48.84 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  53.27 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  52.28 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  50.73 
 
 		 228 aa  184  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.83 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  56.12 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  49.74 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  45.19 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 688 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44.22 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.64 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.5 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  42.36 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  45.96 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  41.98 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.57 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  42.19 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  41.52 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.64 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 901 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.17 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  40.7 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  43.32 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.21 
 
 		 707 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  41.58 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.05 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 730 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  40.62 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.44 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  41.28 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>