More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0718 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  55.5 
 
 
210 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  55.5 
 
 
210 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  55.5 
 
 
210 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.24 
 
 
204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  51.42 
 
 
218 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  54.85 
 
 
207 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  55.02 
 
 
210 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  54.55 
 
 
212 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  55.02 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.63 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  52.15 
 
 
210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  52.63 
 
 
210 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  51.21 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  49.26 
 
 
206 aa  209  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  49.28 
 
 
208 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50 
 
 
217 aa  207  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  52.4 
 
 
208 aa  205  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  52.88 
 
 
211 aa  205  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.1 
 
 
200 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  47.34 
 
 
205 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  49.06 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  46.86 
 
 
212 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  46.92 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.06 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  45.67 
 
 
223 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  47 
 
 
203 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  45.67 
 
 
223 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.89 
 
 
203 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  49.27 
 
 
206 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.04 
 
 
206 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.58 
 
 
205 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  48.11 
 
 
206 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  48.11 
 
 
206 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  48.11 
 
 
206 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  47.17 
 
 
206 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  47.17 
 
 
206 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  45.5 
 
 
206 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  47.17 
 
 
206 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  47.17 
 
 
206 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  45.93 
 
 
204 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  49.76 
 
 
215 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  45.97 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.02 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.89 
 
 
214 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  46.04 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.79 
 
 
686 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  48.69 
 
 
233 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.42 
 
 
206 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.95 
 
 
219 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.84 
 
 
210 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1918  thymidylate kinase  46.6 
 
 
217 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.45 
 
 
705 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.86 
 
 
213 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.9 
 
 
703 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.31 
 
 
215 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.11 
 
 
214 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.94 
 
 
217 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  45.5 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.38 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.35 
 
 
671 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.83 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  42.38 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.12 
 
 
225 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.21 
 
 
213 aa  161  7e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.28 
 
 
203 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.7 
 
 
209 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  38.03 
 
 
212 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  40.67 
 
 
707 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.23 
 
 
213 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.58 
 
 
688 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  38.03 
 
 
212 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.43 
 
 
217 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.84 
 
 
211 aa  158  5e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  43.08 
 
 
213 aa  158  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.63 
 
 
205 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.59 
 
 
211 aa  157  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.33 
 
 
202 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  42.57 
 
 
212 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  44.93 
 
 
226 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.13 
 
 
222 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  38.76 
 
 
208 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  38.28 
 
 
208 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.7 
 
 
216 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  38.28 
 
 
208 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37.86 
 
 
207 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  42.86 
 
 
211 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  38.28 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>