More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1971 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  54.76 
 
 		 688 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  100 
 
 		 688 aa  1342    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  51.7 
 
 		 901 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  52.66 
 
 		 686 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  51.32 
 
 		 686 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  49.55 
 
 		 730 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  46.93 
 
 		 709 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.21 
 
 		 707 aa  535  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  49.63 
 
 		 662 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 705 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  46.26 
 
 		 703 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  46.13 
 
 		 707 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 727 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.14 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 725 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 710 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 642 aa  299  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  62.03 
 
 		 213 aa  204  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.47 
 
 		 207 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 224 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  52.61 
 
 		 222 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  59.79 
 
 		 225 aa  193  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  51.22 
 
 		 234 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  50.49 
 
 		 232 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  52.15 
 
 		 210 aa  190  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.84 
 
 		 217 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 226 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  50.23 
 
 		 281 aa  187  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  54.84 
 
 		 210 aa  185  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  52.53 
 
 		 215 aa  183  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  54.59 
 
 		 210 aa  183  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 209 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.05 
 
 		 207 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  52.6 
 
 		 206 aa  181  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  48.97 
 
 		 210 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  50.81 
 
 		 221 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.03 
 
 		 213 aa  177  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 211 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 210 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  48.65 
 
 		 243 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 221 aa  173  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.2 
 
 		 219 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 207 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.65 
 
 		 212 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 217 aa  172  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50 
 
 		 207 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 207 aa  170  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  46.19 
 
 		 214 aa  170  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 206 aa  170  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 213 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.5 
 
 		 204 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  48.51 
 
 		 224 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  52.63 
 
 		 244 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46 
 
 		 216 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 226 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 211 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  46.28 
 
 		 218 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 236 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 202 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 213 aa  167  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 208 aa  167  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.48 
 
 		 205 aa  167  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 214 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.93 
 
 		 215 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 234 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  52.63 
 
 		 244 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  49.21 
 
 		 226 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 208 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.12 
 
 		 203 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 211 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 205 aa  165  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.5 
 
 		 212 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.67 
 
 		 221 aa  164  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  48.11 
 
 		 225 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  50 
 
 		 236 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 207 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 206 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.24 
 
 		 205 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  48.58 
 
 		 206 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  49.46 
 
 		 203 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43 
 
 		 209 aa  162  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  44.85 
 
 		 213 aa  162  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 213 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 215 aa  162  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  50 
 
 		 219 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  48.58 
 
 		 206 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  48.11 
 
 		 206 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  48.58 
 
 		 206 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 206 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 206 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 206 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 200 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.86 
 
 		 197 aa  160  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 225 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 219 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>