More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1314 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  99.53 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  99.53 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  90.95 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  90.48 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  90.48 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  85.92 
 
 		 213 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  69.34 
 
 		 219 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  68.72 
 
 		 212 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  68.72 
 
 		 212 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  68.25 
 
 		 212 aa  294  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  69.67 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  71.5 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  67.94 
 
 		 215 aa  287  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  63.77 
 
 		 210 aa  281  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  66.35 
 
 		 217 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  60.19 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  58.57 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  55.66 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  53.66 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  53.3 
 
 		 223 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  55.45 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  53.43 
 
 		 212 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  53.47 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  52.38 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  52.48 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  53.5 
 
 		 215 aa  207  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  53.27 
 
 		 215 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  52.68 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  51.98 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  51.98 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  52.48 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  50 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  50 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  51.49 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.06 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.45 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.55 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.96 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.08 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  47.52 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.79 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  44.71 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.41 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  43.65 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>