More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4954 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  60.83 
 
 
686 aa  769    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  100 
 
 
707 aa  1364    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  51.01 
 
 
688 aa  628  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  50.64 
 
 
686 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.13 
 
 
688 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.48 
 
 
901 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.75 
 
 
707 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  42.96 
 
 
730 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.72 
 
 
662 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.08 
 
 
705 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  40.4 
 
 
709 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.02 
 
 
703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.35 
 
 
671 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  37.48 
 
 
727 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
725 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
710 aa  296  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  33.88 
 
 
642 aa  269  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  58.62 
 
 
213 aa  219  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  54.73 
 
 
222 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  51.71 
 
 
232 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  49.09 
 
 
226 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50 
 
 
205 aa  188  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  50.68 
 
 
224 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  53.88 
 
 
225 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  51.47 
 
 
202 aa  180  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.83 
 
 
207 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  51.1 
 
 
234 aa  178  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  51.1 
 
 
210 aa  177  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  48.82 
 
 
215 aa  177  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.83 
 
 
206 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.5 
 
 
222 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.19 
 
 
207 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.7 
 
 
224 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.24 
 
 
203 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  45.5 
 
 
211 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.71 
 
 
219 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.46 
 
 
215 aa  167  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.81 
 
 
207 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.5 
 
 
208 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.02 
 
 
215 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  45.32 
 
 
207 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.87 
 
 
206 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.44 
 
 
219 aa  161  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.91 
 
 
213 aa  160  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.4 
 
 
214 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.37 
 
 
221 aa  159  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.33 
 
 
218 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  50.25 
 
 
219 aa  158  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.48 
 
 
217 aa  158  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.79 
 
 
213 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  49.18 
 
 
281 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.83 
 
 
217 aa  158  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.76 
 
 
210 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  47.55 
 
 
204 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  42.72 
 
 
234 aa  157  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.72 
 
 
209 aa  157  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.88 
 
 
207 aa  157  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.46 
 
 
210 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  47.98 
 
 
243 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.97 
 
 
214 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.81 
 
 
212 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  44.83 
 
 
209 aa  154  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.93 
 
 
221 aa  153  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.43 
 
 
234 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.79 
 
 
213 aa  152  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.5 
 
 
217 aa  152  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  42.36 
 
 
212 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  41.38 
 
 
212 aa  151  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.76 
 
 
204 aa  151  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  36.82 
 
 
206 aa  151  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  37.93 
 
 
216 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  41.78 
 
 
218 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  40.39 
 
 
212 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.03 
 
 
211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  42.2 
 
 
225 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  41.71 
 
 
214 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.72 
 
 
211 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.21 
 
 
216 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.06 
 
 
221 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  46.77 
 
 
244 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.69 
 
 
213 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  35.18 
 
 
208 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  35.27 
 
 
208 aa  147  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.61 
 
 
208 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.59 
 
 
197 aa  147  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.2 
 
 
210 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.2 
 
 
208 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.26 
 
 
225 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  38.35 
 
 
213 aa  146  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  34.67 
 
 
208 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  48.04 
 
 
209 aa  145  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  42.56 
 
 
197 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.57 
 
 
222 aa  145  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>