67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4677 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  89.05 
 
 		 421 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  47.73 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 419 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  40 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  35.52 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  39.57 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  31.3 
 
 		 452 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  32.04 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.76 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.76 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.76 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  30.65 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.46 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.46 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.11 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.56 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.18 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.18 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  22.41 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.16 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  27.3 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.32 
 
 		 1833 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  30.43 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  31.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  31.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  31.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  22.86 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.23 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>