189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3912 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  80.98 
 
 		 465 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  39.49 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  36.57 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  36.07 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  31.51 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  32.97 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.22 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  27.69 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  31.56 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.07 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 440 aa  57  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.58 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.98 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  19.37 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.38 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.98 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  20.75 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.38 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.69 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  26.86 
 
 		 688 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  25.85 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.11 
 
 		 460 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.15 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.01 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.01 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.34 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.91 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  23.83 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  26.11 
 
 		 730 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 727 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  24.8 
 
 		 705 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.64 
 
 		 1833 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>