More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3189 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  853    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  81.86 
 
 		 442 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  49.33 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  49.78 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  48.08 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  48.78 
 
 		 444 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  47.06 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  51.13 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  49.78 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  49.75 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  49.66 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 420 aa  296  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  37.44 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  46.83 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  43.01 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  25.85 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.54 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  19.84 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  23.82 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.57 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.29 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.73 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.22 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.85 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.48 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  19.73 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.48 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.8 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.32 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.48 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.48 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  25.24 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.64 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.3 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.3 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.15 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  25.29 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.47 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  31.85 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  31.85 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.47 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.94 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.62 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.94 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.4 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.37 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.89 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.62 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.27 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.1 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.39 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  31.11 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.1 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  31.11 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.1 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  31.11 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.53 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  29.01 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.56 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>