More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3139 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  877    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  52.8 
 
 		 438 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  54.04 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  52.47 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  53.03 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  51.22 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  53.68 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  53.59 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 421 aa  300  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  50.28 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  38.54 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  43.37 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.64 
 
 		 1833 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.66 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.45 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.65 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.17 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.75 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.19 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.05 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.33 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.37 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.55 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.55 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.55 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.36 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.21 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.16 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  21.64 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  21.64 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  21.64 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.22 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.04 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.22 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.19 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.48 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.8 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.99 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  24.6 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.81 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.22 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.75 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  22.72 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.24 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.59 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.24 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.24 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>