289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5611 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  861    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  71.98 
 
 		 438 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  69.63 
 
 		 436 aa  594  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  70.48 
 
 		 436 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  67.43 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  70.55 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  66.97 
 
 		 440 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  66.81 
 
 		 444 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  61.49 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  67.04 
 
 		 444 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  67.04 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  65.26 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  59.37 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  54.04 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  55.14 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  59.56 
 
 		 457 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  53.51 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  43.44 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  48.79 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  49.44 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.07 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.07 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.06 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.4 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.7 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.13 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.32 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.56 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.56 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.49 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.49 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  26.32 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.09 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  25.17 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  25.17 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  25.17 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.35 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  24.14 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  24.48 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.65 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  24.48 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  24.61 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  22.8 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.67 
 
 		 1833 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  30.99 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2362  putative NreB protein  45.36 
 
 		 119 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.23 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  27.27 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.23 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  24.64 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  24.4 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  27.59 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.14 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>