More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2122 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  100 
 
 
424 aa  850    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
426 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.48 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  27.96 
 
 
404 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  27.96 
 
 
404 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25.26 
 
 
404 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.97 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.69 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  25.5 
 
 
402 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  26.19 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  25.51 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  22.79 
 
 
395 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  22.79 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  22.55 
 
 
395 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  24.85 
 
 
379 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
396 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  23.32 
 
 
397 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  35.21 
 
 
393 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
390 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  23.23 
 
 
398 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.92 
 
 
686 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  22.28 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  26.65 
 
 
730 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  25.44 
 
 
567 aa  92.8  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  32.22 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  22.96 
 
 
397 aa  92  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.53 
 
 
474 aa  90.1  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
428 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.52 
 
 
406 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  26.63 
 
 
688 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.68 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.4 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.69 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  27.54 
 
 
709 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
444 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.93 
 
 
390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.93 
 
 
390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.46 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.46 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.65 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.21 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  29.58 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  29.58 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  28.57 
 
 
686 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  26.61 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.7 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.69 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.2 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
408 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  24.66 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.2 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.68 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  29.18 
 
 
662 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.25 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.14 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  23.59 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  24.42 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.76 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.14 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.14 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  25.41 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.16 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  29.9 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.21 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.09 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.43 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.87 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  26.92 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.48 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  27.89 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 
482 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.06 
 
 
209 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  25.53 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.31 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.89 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.53 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.53 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.03 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>