260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1522 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 398 aa  793    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  73.62 
 
 		 398 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  56.71 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  51.65 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  51.65 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  51.65 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  43.64 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.77 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  23.53 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.14 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.83 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  26.13 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.66 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  22.4 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.06 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  21.92 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.1 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  22.6 
 
 		 567 aa  66.6  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.92 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  20.95 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  23.18 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.48 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  20.59 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  21.37 
 
 		 1816 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.26 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  21.31 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.65 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.99 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  24.59 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  19.85 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  20.95 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  22.17 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.47 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.47 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  25.14 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  21.08 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  20.57 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  20.86 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.64 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  20.63 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.73 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 457 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 710 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  22.05 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  23.27 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  20.45 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  20.57 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  20.78 
 
 		 730 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  19.66 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>