More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4030 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  778    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  92.49 
 
 
413 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
426 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.87 
 
 
424 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.8 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.2 
 
 
404 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.2 
 
 
404 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.67 
 
 
404 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.67 
 
 
404 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.92 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.38 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
412 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.18 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.25 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
433 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  21.98 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
404 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.75 
 
 
413 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.02 
 
 
436 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  30.51 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.07 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0414  macrolide-efflux protein  22.25 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.743793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.64 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  22.28 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  26.15 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  29 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  29 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.25 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  29 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  25.13 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.49 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.21 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.26 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.78 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  26.3 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  21.74 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  22.01 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  21.33 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.36 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.3 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.11 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.78 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.65 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.1 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  30 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.93 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.95 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  23.99 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  29.92 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.93 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.11 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  22.66 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.73 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.99 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.65 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.54 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  22.07 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  30.71 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.94 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.94 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  27.37 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  31.94 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.48 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.96 
 
 
418 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  21.84 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  27.37 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.91 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.99 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.16 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  26.48 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.73 
 
 
454 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.19 
 
 
1833 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.01 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  28.57 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.01 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  31.48 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  28.65 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  30.66 
 
 
526 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>