183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5396 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 450 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  35.2 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 427 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  34.83 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  37.02 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  37 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  34.62 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  35.14 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  35.93 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  35.93 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  35.93 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  34.52 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.3 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  25.88 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.5 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  24.93 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  24.92 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.15 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.54 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  21.78 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.54 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.54 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.54 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.89 
 
 		 686 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.7 
 
 		 1833 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.94 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.54 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.54 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.93 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.54 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.29 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.55 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  19.42 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  21.87 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  31.25 
 
 		 730 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  23.68 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  26.1 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 598 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.01 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 482 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 482 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.86 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  25 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.23 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 		 1816 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.51 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.43 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>