190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9035 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  856    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  47.33 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  43.88 
 
 
432 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 
427 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  44.31 
 
 
450 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  43.41 
 
 
441 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 
435 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  44.69 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
442 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 
491 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  43.09 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  41.22 
 
 
462 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
436 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
431 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
428 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  34.65 
 
 
436 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
434 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
453 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  36.63 
 
 
427 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  35.61 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  32.08 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  37.66 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  37.66 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  37.66 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  26.63 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.08 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.19 
 
 
434 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.92 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.92 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.28 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  25.28 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25 
 
 
688 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  23.45 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.76 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  21.37 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.35 
 
 
434 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  22.72 
 
 
460 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  26.46 
 
 
459 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  19.9 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.49 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.7 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.66 
 
 
709 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
727 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  20.54 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  23.98 
 
 
688 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  22.18 
 
 
446 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.66 
 
 
644 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  25.81 
 
 
730 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.66 
 
 
644 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  29.41 
 
 
624 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  22.94 
 
 
604 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  22.94 
 
 
604 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  22.94 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.21 
 
 
686 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  28.89 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.2 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.2 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  22.94 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  22.94 
 
 
644 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.2 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  22.08 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
441 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  22.94 
 
 
644 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  27.31 
 
 
626 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.87 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  23.74 
 
 
644 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.34 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  28.29 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.44 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
448 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  22.15 
 
 
400 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  18.67 
 
 
423 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  22.64 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  24.49 
 
 
707 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.42 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  21.84 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  21.84 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  21.84 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.27 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  21.52 
 
 
400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  27.1 
 
 
404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  27.1 
 
 
404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.8 
 
 
474 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  23.79 
 
 
462 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  21.84 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  21.84 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  27.87 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.74 
 
 
644 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>