65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4834 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  828    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  44.24 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  44.52 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  45.76 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  45.76 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  45.76 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  38.19 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  38.38 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  40 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  38.75 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 491 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  36.23 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 476 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  33.59 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 453 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  22.1 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 451 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.25 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.22 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30.64 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  21.73 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  21.73 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 727 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  34.4 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  24.24 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.07 
 
 		 688 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  20.91 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.45 
 
 		 686 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.12 
 
 		 730 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  24.54 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.01 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>