35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0501 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  100 
 
 
529 aa  1011    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  93.19 
 
 
543 aa  922    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  43.05 
 
 
481 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  42.54 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  42.3 
 
 
598 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  42.59 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  39.63 
 
 
512 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  36.81 
 
 
578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  36.97 
 
 
561 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  36.43 
 
 
505 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  36.39 
 
 
566 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  36.39 
 
 
566 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  36.39 
 
 
566 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  34.99 
 
 
548 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  37.5 
 
 
533 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  35.94 
 
 
548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  33.64 
 
 
560 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
576 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  30.45 
 
 
426 aa  103  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  26.91 
 
 
454 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  28.64 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  32.8 
 
 
432 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  27.94 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  28.12 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  28.12 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  28.12 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
428 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
434 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
441 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>