153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4203 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
491 aa  943    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  61.18 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  63.43 
 
 
435 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  58.28 
 
 
432 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
434 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  46.14 
 
 
433 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  42.09 
 
 
432 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  43.13 
 
 
450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
427 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  36.98 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  41.71 
 
 
441 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  40.27 
 
 
476 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  40.19 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
434 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
436 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  36.05 
 
 
454 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  35.38 
 
 
441 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 
442 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
441 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  38.92 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  38.92 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  38.92 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
416 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.99 
 
 
460 aa  87  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  30.41 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.45 
 
 
707 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  27.98 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  27.75 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  28.26 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  26.17 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  25.93 
 
 
578 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
515 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.05 
 
 
686 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.34 
 
 
901 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.12 
 
 
459 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 
482 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
482 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  25.29 
 
 
543 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  23.79 
 
 
688 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.14 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
522 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  23.19 
 
 
420 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.15 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
663 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.01 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.1 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  20.35 
 
 
450 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  25.19 
 
 
481 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  19.07 
 
 
400 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  20.32 
 
 
397 aa  54.7  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.88 
 
 
399 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
499 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  25.31 
 
 
686 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  30.19 
 
 
709 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
486 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  26.13 
 
 
543 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  26.38 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  19.07 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  18.8 
 
 
400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  24.35 
 
 
705 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  18.8 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  25.63 
 
 
707 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  19.62 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  23.7 
 
 
561 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3650  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.66 
 
 
730 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  19.62 
 
 
400 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  18.8 
 
 
400 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  18.8 
 
 
400 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  25.18 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  18.8 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  19.62 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
444 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  23.56 
 
 
703 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
432 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
414 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  24.67 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  26.35 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  19.05 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  21.61 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.46 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.11 
 
 
688 aa  48.5  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  27.13 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  36.56 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  24.32 
 
 
432 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.99 
 
 
410 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
432 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
433 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
432 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
441 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
710 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>