22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1238 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 663 aa  1318    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  55.89 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  52.35 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  52.06 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  54.11 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  52.02 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  52.02 
 
 		 566 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  52.02 
 
 		 566 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  49.09 
 
 		 578 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  48.76 
 
 		 548 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 481 aa  235  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  36.73 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 598 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  35.55 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 529 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 543 aa  173  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  29.71 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 442 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  21.69 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>