40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0814 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 515 aa  967    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  47.87 
 
 		 578 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 481 aa  299  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 663 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  40.04 
 
 		 561 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  43.18 
 
 		 533 aa  279  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  39.07 
 
 		 548 aa  270  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  38.34 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  38.22 
 
 		 560 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  44.42 
 
 		 512 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 449 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  44.5 
 
 		 505 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  46.47 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 426 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  26.33 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.26 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.91 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 725 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.62 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.4 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.68 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.93 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.93 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  39.06 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  31.35 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>