21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10893 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  75.52 
 
 		 566 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  100 
 
 		 548 aa  1089    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  75.52 
 
 		 566 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  75.09 
 
 		 561 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  75.33 
 
 		 566 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  72.52 
 
 		 533 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  54.89 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 		 663 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  49.49 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  47.22 
 
 		 548 aa  331  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  36.5 
 
 		 533 aa  204  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 529 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  34.16 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  30.67 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 426 aa  104  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>