30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0153 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  100 
 
 		 598 aa  1150    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  77.63 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 481 aa  300  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  43.19 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 529 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  38.92 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  39.22 
 
 		 505 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 		 561 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  38.25 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  36.71 
 
 		 548 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  38.89 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 663 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  36.52 
 
 		 548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.42 
 
 		 1864 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.41 
 
 		 2914 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.42 
 
 		 1829 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  28.3 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  33.75 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>