25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0828 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 560 aa  1122    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  55.89 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  57.17 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  54.46 
 
 		 548 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  55.46 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  56.73 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  55.46 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  55.46 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  47.35 
 
 		 578 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  49.34 
 
 		 548 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 576 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 598 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  36.81 
 
 		 533 aa  223  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 529 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  35.35 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  31.25 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  24.3 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>