32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3931 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  870    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  43.75 
 
 		 512 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 529 aa  266  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  42.69 
 
 		 533 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 598 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  42.04 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  41.02 
 
 		 578 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  37.2 
 
 		 561 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  35.6 
 
 		 548 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  40.8 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 566 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  35.66 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 663 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  33.41 
 
 		 560 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 576 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  23.89 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0355  major facilitator superfamily permease  21.37 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0427914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  29.58 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  22.87 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>