35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0413 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  93.19 
 
 		 529 aa  901    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  100 
 
 		 543 aa  1040    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  40.17 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 598 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  39.3 
 
 		 512 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  36.55 
 
 		 578 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  36.97 
 
 		 561 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  36.39 
 
 		 505 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 566 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 566 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  35.48 
 
 		 566 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  36.91 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 533 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  36.58 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  33.1 
 
 		 560 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 663 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  27.74 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  27.85 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  28.69 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  28.69 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  28.69 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  32 
 
 		 432 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  25.39 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>