44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  100 
 
 		 512 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  46 
 
 		 481 aa  339  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 449 aa  319  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  44.5 
 
 		 533 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 598 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 515 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 543 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  41.73 
 
 		 505 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  37.98 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  33.49 
 
 		 561 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 663 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  34.41 
 
 		 566 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 566 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  34.16 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 533 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  34.08 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  35.75 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  25.39 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  26.92 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  33.09 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  33.09 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  33.09 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.96 
 
 		 1128 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.59 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.68 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  26.49 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.53 
 
 		 1114 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.24 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  30.08 
 
 		 432 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>