179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9367 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  68.31 
 
 
441 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  48.22 
 
 
433 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 
427 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
434 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  45.6 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 
431 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  43.66 
 
 
462 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  41.08 
 
 
476 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  38.77 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 
435 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
436 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
442 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  35.87 
 
 
441 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
491 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
416 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  39.58 
 
 
432 aa  216  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  35.43 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
441 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
428 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  36.5 
 
 
454 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  36.54 
 
 
427 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  36.54 
 
 
427 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  36.54 
 
 
427 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  26.68 
 
 
707 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.65 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.4 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.84 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.36 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  25.39 
 
 
547 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.39 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  26.33 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.73 
 
 
399 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.33 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  32.88 
 
 
709 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
444 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.43 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.43 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  26.85 
 
 
512 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.05 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  20.6 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.16 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.43 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  23.85 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.79 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  26.15 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  22.11 
 
 
462 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  30.3 
 
 
730 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.97 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.51 
 
 
412 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  21.74 
 
 
405 aa  53.1  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.97 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.97 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  25 
 
 
543 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.97 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  27.11 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.77 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  21.84 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.26 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  30.57 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.33 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.88 
 
 
686 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.24 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  21.69 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  21.78 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
515 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.66 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.61 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
725 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  23.23 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  21.26 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.43 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  21.26 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  21.61 
 
 
432 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  32.89 
 
 
686 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  25.57 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  29.58 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>