More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.02 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.46 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.46 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.18 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.91 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.91 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.91 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  23.71 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  24.12 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.82 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 450 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.63 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  29.21 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.35 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.06 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.06 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.79 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  28.5 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.56 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.07 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.37 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.93 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.93 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.6 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.6 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.12 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.26 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.12 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.8 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  35.23 
 
 		 209 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  28.31 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.82 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.95 
 
 		 1833 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.26 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 474 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.33 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.36 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.93 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  27.63 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.18 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  35.43 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.99 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.46 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.56 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.22 
 
 		 707 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.64 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.28 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.46 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.64 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.21 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.28 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.64 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24.09 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>