More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0655 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  100 
 
 		 460 aa  895    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  87.61 
 
 		 459 aa  734    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  70.22 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  50 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  42.43 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  42.13 
 
 		 547 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 543 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 		 522 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  35.02 
 
 		 415 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 397 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.31 
 
 		 730 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  26.01 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  26.01 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  26.01 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25.86 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.12 
 
 		 901 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  26.4 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  26.54 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  27.01 
 
 		 709 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  26.46 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.59 
 
 		 686 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  25.23 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  26.01 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.22 
 
 		 1833 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  26.09 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.35 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.99 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25.31 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.05 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  25.61 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  28.17 
 
 		 703 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  27.37 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.85 
 
 		 1114 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.96 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.39 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.74 
 
 		 1128 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.77 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.34 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  24.94 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.77 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  23.97 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.14 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  26.72 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.25 
 
 		 1136 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  25 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.86 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.86 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  20.29 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>