More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4496 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.08 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 432 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 420 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.85 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.6 
 
 		 415 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.41 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.41 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.41 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.68 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.61 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  32 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  30.25 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  21.17 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.43 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 474 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 413 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 413 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.37 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  28.46 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  28.22 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  28.22 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  28.46 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  28.09 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.17 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.09 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.09 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.54 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.28 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.04 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.03 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>