More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2016 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  87.61 
 
 		 460 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  100 
 
 		 459 aa  897    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  72.61 
 
 		 471 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  48.93 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  44.37 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  42.86 
 
 		 547 aa  285  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 482 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 522 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 486 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 543 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  35.59 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 404 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.17 
 
 		 730 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  25.12 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25.89 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.04 
 
 		 686 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25.92 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  27.62 
 
 		 709 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.21 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  25.63 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.67 
 
 		 901 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  25.63 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.63 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.41 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  25.21 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.31 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.15 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.69 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.79 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.79 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.23 
 
 		 1114 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  24.64 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  27.16 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.24 
 
 		 1833 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.26 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  25.51 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 707 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  25.55 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.59 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.99 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.38 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.29 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  24.93 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  20.88 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.17 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.45 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.92 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  26.07 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>