148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4220 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  846    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  49.54 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  46.12 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  48.43 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  48.42 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  48.42 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  48.42 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  39.8 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  42.09 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  33.83 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  38.14 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  38.67 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 427 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 431 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  37.29 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  27.3 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  24.32 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  21.94 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  26.74 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  29.28 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.1 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  29.96 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  20.06 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  25.07 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  19.51 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.78 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  19.23 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  19.23 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  19.51 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  19.28 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.07 
 
 		 1816 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  18.41 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  25.75 
 
 		 730 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 533 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 		 1833 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  19.7 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  19.7 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.76 
 
 		 686 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.44 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  34.62 
 
 		 709 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  20.8 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 727 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  29.82 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  29.94 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  25.2 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  27.32 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.73 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  21.85 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  21.45 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  21.19 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  28.95 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  28.95 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  28.95 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.03 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  25.34 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  28.02 
 
 		 533 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.64 
 
 		 707 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  28 
 
 		 598 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.83 
 
 		 404 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 461 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30.67 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>