More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3773 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  39.43 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  37.17 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  37.17 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  36.91 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  36.91 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  36.91 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  36.91 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  40.31 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  33 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  34.24 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  33.49 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 461 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  30.23 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.51 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  29.04 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  29.35 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  29.03 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  29.7 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  29.03 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  29.03 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.44 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  32.84 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  29.76 
 
 		 551 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.29 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  34.5 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1463  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  29.9 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.06 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  31 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  28.1 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.5 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  31.96 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.75 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  31.07 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>