122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6058 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 427 aa  828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  81.37 
 
 		 454 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  73 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  73 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  73 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  66.03 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  34.26 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  35.43 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  36.06 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  36.04 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  36.27 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 491 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 450 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  31.14 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  25.44 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.7 
 
 		 709 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.32 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  25.12 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  26.83 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  24.07 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  26.3 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.1 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  37.07 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.62 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  24.1 
 
 		 688 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  30.14 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  33.82 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.04 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  27.42 
 
 		 686 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  30 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 725 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  35.34 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  25.62 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.33 
 
 		 686 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.36 
 
 		 1864 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  32.76 
 
 		 662 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 		 629 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  27.1 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.46 
 
 		 1876 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  26.49 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 458 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.18 
 
 		 1833 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.07 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  24.65 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  31.33 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.61 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.61 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  24.68 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.61 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  24.87 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.94 
 
 		 1829 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.61 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  26.39 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>