191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3595 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  880    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  62.41 
 
 
431 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  56.64 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  42.14 
 
 
435 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  41.89 
 
 
435 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.02 
 
 
645 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.8 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.53 
 
 
634 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.5 
 
 
645 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.62 
 
 
644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  38.16 
 
 
645 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.41 
 
 
632 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.37 
 
 
637 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  37.35 
 
 
644 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.29 
 
 
644 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  38.68 
 
 
644 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.29 
 
 
644 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.8 
 
 
644 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.8 
 
 
644 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.8 
 
 
644 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  37.56 
 
 
635 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.56 
 
 
635 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.8 
 
 
635 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.94 
 
 
625 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  37.64 
 
 
604 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  37.64 
 
 
604 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  37.64 
 
 
644 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  37.64 
 
 
644 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  37.64 
 
 
644 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
432 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  35.75 
 
 
446 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  39.06 
 
 
640 aa  260  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.46 
 
 
644 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  37.38 
 
 
429 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  34.81 
 
 
446 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.52 
 
 
620 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.78 
 
 
621 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.67 
 
 
654 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.59 
 
 
620 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.53 
 
 
620 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  37.76 
 
 
618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.82 
 
 
653 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.79 
 
 
620 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.52 
 
 
620 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.79 
 
 
624 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.26 
 
 
620 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.65 
 
 
629 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.26 
 
 
620 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.29 
 
 
662 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  36.59 
 
 
632 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  36.76 
 
 
620 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  39.23 
 
 
624 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.72 
 
 
620 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  36.83 
 
 
1138 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  36.83 
 
 
1138 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.45 
 
 
589 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.1 
 
 
658 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.83 
 
 
651 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.98 
 
 
625 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.43 
 
 
651 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  35.51 
 
 
617 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  36.21 
 
 
618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.65 
 
 
625 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  37.44 
 
 
626 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.99 
 
 
652 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
624 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.32 
 
 
661 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  42.42 
 
 
453 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  39.69 
 
 
624 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.59 
 
 
644 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.32 
 
 
625 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  37.63 
 
 
624 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.34 
 
 
624 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  37 
 
 
1138 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  38.68 
 
 
624 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  37.28 
 
 
624 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  37.32 
 
 
1137 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.4 
 
 
618 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  36.28 
 
 
560 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  36 
 
 
439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.9 
 
 
1139 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  36.14 
 
 
1139 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.69 
 
 
1131 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.17 
 
 
1131 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.5 
 
 
1144 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  34.38 
 
 
429 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 
430 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  33.5 
 
 
442 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.52 
 
 
629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  30.05 
 
 
435 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1714  major facilitator transporter  31.34 
 
 
538 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1012  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  26.08 
 
 
1133 aa  150  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.888633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.53 
 
 
1128 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.48 
 
 
1155 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0201  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
454 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
1185 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.6 
 
 
1136 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
1049 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  24.04 
 
 
559 aa  100  5e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.34 
 
 
1131 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>