33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8901 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  972    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  40.52 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  40.13 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 515 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 543 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  37.63 
 
 		 578 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 529 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  37.37 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  33.02 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 566 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  31.05 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  29.58 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 663 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 576 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  24.41 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.9 
 
 		 1833 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  25.75 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  24.54 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>