182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3101 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  833    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  66.2 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  48.22 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  55.1 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  49.76 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  45.86 
 
 		 462 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  43.87 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  35.94 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  36.04 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  37.79 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  36.41 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  36.41 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  36.41 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  28.91 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  27.38 
 
 		 707 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  31.85 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.95 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  23.68 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.88 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  27.69 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.82 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.82 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.93 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.82 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.12 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  20.88 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.12 
 
 		 1833 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.27 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.5 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.43 
 
 		 688 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  26.89 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.84 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  29.08 
 
 		 688 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  19.78 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.73 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.07 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.3 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.82 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.6 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  25 
 
 		 703 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.55 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  31.19 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  31.19 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  23.84 
 
 		 460 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>