94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3708 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
435 aa  811    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  62.12 
 
 
432 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  63.43 
 
 
491 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  53.78 
 
 
453 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
428 aa  323  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  45.35 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  42.69 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 
427 aa  246  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  39.34 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  40.83 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  40.79 
 
 
450 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
431 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  40.95 
 
 
476 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  41.09 
 
 
462 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
434 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
436 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
442 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
441 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  36.07 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  34.94 
 
 
427 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  33.26 
 
 
441 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  37.68 
 
 
427 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  37.68 
 
 
427 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  37.68 
 
 
427 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  28.06 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
450 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.78 
 
 
707 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
515 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  25.42 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  29.6 
 
 
459 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.18 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  24.94 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  26.19 
 
 
543 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  28.03 
 
 
598 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  27.9 
 
 
465 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
522 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  30.96 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  28.39 
 
 
529 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.79 
 
 
1806 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.61 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  23.79 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
444 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.36 
 
 
404 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
482 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  28.3 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  27.67 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  27.67 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  27.67 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  27.67 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  27.67 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  22.64 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  29.38 
 
 
512 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.76 
 
 
901 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  32.54 
 
 
543 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  28.3 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
399 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.84 
 
 
418 aa  47  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
421 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.96 
 
 
688 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  26.94 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  24.88 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.73 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.4 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  31.45 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  22.33 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.14 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.86 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  30.33 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  22.08 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  34.78 
 
 
533 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  20.5 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.91 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  23.15 
 
 
399 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  21.86 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.86 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  31.25 
 
 
460 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.86 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
440 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>