More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3442 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  858    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 		 432 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  40.05 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  39.52 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  32.86 
 
 		 485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  30.58 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  32.72 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.26 
 
 		 1833 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  27.44 
 
 		 405 aa  143  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  33.6 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  31.46 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.61 
 
 		 1816 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25.13 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 442 aa  107  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.26 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.71 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.18 
 
 		 1876 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.45 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.18 
 
 		 1829 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  27.11 
 
 		 1769 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.34 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.32 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.12 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.2 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.2 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.36 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.2 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.8 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.32 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.25 
 
 		 2720 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  26.33 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 450 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  26.6 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  26.94 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.39 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.08 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.35 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.77 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.98 
 
 		 1864 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>